Under et ophold på DTU Fødevareinstituttet har unge forskere fra Ghana, Senegal og Sydafrika samarbejdet med danske kolleger om at afprøve nye metoder til at overvåge antibiotikaresistens. De nye redskaber bliver nu tilpasset og anvendt i deres egne laboratorier.
”Oplevelsen gav mig selvtillid til at netværke og udveksle idéer og erfaringer. Det gav mig et stærkt fundament til at fortsætte med at opbygge og lære nye måder at navigere i genomik-verdenen,” fortæller Sade Magabotha, bioinformatiker ved Sydafrikas National Institute for Communicable Diseases (NICD), Centre of Enteric Diseases (Bacteriology).
Videndeling på tværs af landegrænser
Træningsforløbene, som kaldes ”Twinning”, er en del af SeqAfrica, et samarbejde med deltagelse af forskningsinstitutioner i flere afrikanske lande samt Danmark. Projektet ledes af DTU Fødevareinstituttet. Målet er at styrke overvågningen af antibiotikaresistens gennem fælles træning og videndeling, og et centralt element i et Twinning-besøg er, at forskerne arbejder side om side og lærer af hinandens erfaringer.
Fra Lyngby til Dakar
Cheikh Lo fra Institut Pasteur de Dakar i Senegal deltog i et intensivt forløb på DTU, hvor han arbejdede med en række nye værktøjer til resistensbestemmelse, som nu bliver integreret i analyserne i Dakar. William Boateng, Grebstad Rabbi Amuasi og Christian Owusu-Nyantakyi fra Noguchi Memorial Institute for Medical Research i Ghana blev sammen med Sade Magabotha fra National Institute for Communicable Disease i Sydafrika introduceret til bl.a. maskinlæring til forudsigelse af resistens samt visualiseringsværktøjer.
Deltagerne besøgte også Statens Serum Institut og biotekvirksomheden SNIPR Biome. Her fik de indblik i, hvordan overvågning af antibiotikaresistens organiseres i Danmark, og de fik mulighed for at udveksle erfaringer med eksperter i bl.a. overvågningssystemer og metagenomik.
Nye metoder tages i brug
Opholdet i Danmark er ét led i et længere forløb, og deltagerne er allerede i gang med at integrere nye værktøjer og tilpasse metoderne til deres nationale systemer. Flere planlægger f.eks. at afholde workshops, så deres viden kan deles bredere.
”Som tidlig karriere-bioinformatiker kan jeg nu række ud til de nye kolleger, jeg har fået, for at sparre om idéer samt søge deres ekspertise inden for områder, jeg endnu ikke kender så godt,” siger Sade Magabotha.
Et samarbejde med perspektiv
SeqAfrica undersøger nu, hvordan Twinning-modellen kan udvikles, blandt andet med længere ophold, mere strukturerede netværksaktiviteter og bedre planlægning af ressourcer.
”Gennem initiativer som Twinning træner vi ikke kun forskere – vi er med til at opbygge et netværk af fremtidige ledere og skabe nye løsninger på antibiotikaresistens,” siger bioinformatiker og videnskabelig sassistent Niamh Lacy-Roberts fra DTU Fødevareinstitutettet.
Læs mere
Læs mere om SeqAfrica, der er støttet af Fleming Fund.
Læs mere om antibiotikaresistens på DTU Fødevareinstituttets website.
Besøg websitet stopAMR.dk.
